美国BIOLOG公司独家研发的产品 ECO板,特别为微生物群落分析和生态研究设计,Eco板上包含国际土壤微生物学家精选的用于微生物群落分析最常用的31种碳源,是国际上微生物生态功能多样性研究的最典型和最权威方法之一。
每块96孔ECO板上有3组平行,每组31种碳源,3个阴性对照,加入同一样品后,可以获得3组平行数据。微生物群落对这31种碳源的特征性利用称作该微生物群落的代谢指纹图谱。从单个的微平板上的指纹图谱就可以获得大量的代谢信息。可用于纯种及混合菌群(如土壤样品)微生物功能多样性研究。
31种碳源可分为六大类,具体如下:
单糖\糖苷\聚合糖类
B2, D-木糖
H1, a-D-乳糖
A2, ß-甲基D-葡萄糖苷
G2,葡萄糖-1-***酸盐
E1, a-环状糊精
F1, 肝糖
G1, D-纤维二糖
氨基酸类,
A4,L-精氨酸,
B4,L-天冬酰胺酸
C4 L-***基丙氨酸
D4, L-丝氨酸
E4,L-苏氨酸
F4,甘氨酰-L-谷氨酸
酯类
B1, 丙***酸甲酯
C1, 吐温40
D1, 吐温80
A3, D-半乳糖酸γ内酯
醇类
C2, I-赤藻糖醇
D2, D-甘露醇
H2, D,L-a-甘油
胺类
G4, ***乙基胺
H4, 腐胺
E2, N-乙酰基-D-葡萄胺
酸类
B3,D-半乳糖醛酸
F2 D-氨基葡萄糖酸
C3, 2-羟***甲酸
D3, 4-羟基***甲酸
E3,r-羟基丁酸
F3, 衣康酸
G3,a-丁***酸
H3, D-苹果酸
样品简单处理后(过滤或离心),取上清液加到ECO板上培养多至5天时间,每隔一定时间用酶标仪在590nm和750nm下测定OD值,OD值的大小反应样品微生物利用某一碳源底物的能力,将OD值导出后进行分析,如AWCD值(平均吸光度)、丰富度、单孔的动力学分析、不同类碳源的比较等,并可用聚类软件对不同样品进行聚类分析。
值得一提的是ECO板不仅测定可培养微生物,还可测定部分不可培养微生物,只要微生物能利用碳源进行代谢(并不增殖),ECO板上显色体系均可检测出来。
最常见的应用是利用ECO板分析环境因素、根系、叶面、肥料、***对土壤微生物菌群的生态功能多样性的影响,比较不同样品间或同一样品不同时间的功能多样性差异,比较环境修复前后微生物群落的功能多样性差异,等等。
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哺乳动物细胞的表型微阵列BIOLOG表型微阵列哺乳动物测定法是基于细胞的测定法,用于研究哺乳动物细胞的多达1400种代谢和化学敏感性表型。他们使用96孔板预装了碳能和氮底物,离子,激素/细胞因子和抗癌剂。平板接种目标细胞和Biolog专有的氧化还原染料。在一些孔中,细胞被刺激而在其他孔中被抑制。细胞产生的能量丰富的NADH减少了氧化还原染料,并引起了颜色变化,然后使用Biolog的OmniLog自动培养箱阅读器进行读取。表型微阵列哺乳动物测定法可用于多种研究和应用,包括:基因型与表型的相关性研究癌症中的代谢重编程和抗癌药敏感性药物发现研究和毒性筛选细胞系和生物工艺的改进细胞代谢,代谢紊乱,营养细胞能量,生长和死亡细胞系质量控制和认证