寨卡病毒通过识别放射状胶质细胞垂直传播影响小鼠后代的大脑皮层发育
该研究中，上海中科院神经所罗振革课题组发现母系传染ZIKV可以穿越小鼠胎盘屏障（placental barrier），传染放射状胶质细胞引起直接或者间接的神经前体细胞数量减少，导致小鼠后代大脑发育缺陷。该工作首次在小鼠模型中将ZIKV传染以及大脑畸形建立起联系。该研究中转录组测序由伯豪生物提供。
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《Cancer Cell》伯豪客户肿瘤外泌体研究新成果
2016年8月8日，国际著名肿瘤学术期刊《Cancer Cell》（IF：23.214）杂志在线刊登了我国肿瘤研究领域著名科学家，第二军医大学免疫学研究所所长，中国医学科学院院长曹雪涛院士在肺癌研究中的最新研究成果，题为：Tumor Exosomal RNAs Promote Lung Pre-metastatic Niche Formation by Activating Alveolar Epithelial TLR3 to Recruit Neutrophils。该研究首次提出了肿瘤外泌体中的RNA通过激活肺泡上皮细胞（Lung epithelial cells）TLR3（Toll-like receptors）蛋白招募嗜中性粒细胞促进肺预转移微环境形成，从而促进了肿瘤细胞的转移。该工作也为人们进一步认识外泌体对肿瘤转移的深远影响提供了科学依据。该研究中外泌体的small RNA以及lncRNA转录组测序由伯豪生物完成。
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借助Affymetrix Axiom平台使用GWAS研究鸡攻击行为相关基因
研究使用了265只雄性家鸡，通过Affymetrix Axiom基因分型平台进行SNP分型，得到大量高密度SNP位点进行GWAS分析，最终得到33个候选位点。通过Ingenuity Pathway Analysis（IPA）代谢通路分析，将研究对象聚焦到少数几个基因上，并通过使用DF-1细胞系进行表达量验证，最终成功说明了SORCS2基因与鸡攻击行为之间的关系。
该研究中基因分型工作由伯豪生物完成，
使用了Affymetrix Axiom平台的高密度芯片，型号为600K Affymetrix Axiom HD chicken genotyping array。
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《Nature Communications》伯豪客户发现米色脂肪血管生成相关的产热机制研究证明了内皮PDGF-CC参与调控米色脂肪的产热机制，且该产热机制与米色脂肪的血管生成相关。研究中所用的Affymetrix Mouse Gene 2.0 ST Array由伯豪生物提供。
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转录因子Sp9参与神经纹状体苍白球发育过程纹状体是基地神经节的重要组成部分，是一类中型多棘神经元（MSNs）。MSNs的两个重要的基地神经节亚型分别是纹状体黑质（直接通路）和纹状体苍白球（间接通路）。纹状体中5%-10%的神经细胞为多棘内在神经元。已有研究发现一些转录因子（TFs）参与纹状体黑质MSNs的形成，但是TFs在纹状体苍白球MSNs形成过程中的作用还不清晰。本研究通过对一个锌指蛋白转录因子Sp9的深入研究，阐述了该转录因子在纹状体苍白球发育过程中的重要作用。该研究中RNA-seq服务由伯豪生物提供。
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2016年8月：上海伯豪客户应用案例精选
1 Xu Z, Ji C, Zhang Y, Zhang Z, Nie Q, Xu J, Zhang D, Zhang X. Combination analysis of genome-wide association and transcriptome sequencing of residual feed intake in quality chickens. BMC Genomics.2016
2 Zhang Q, Zhang Y, Wang C, Xu Z, Liang Q, An L, Li J, Liu Z, You Y, He M, Mao Y, Chen B, Xiong ZQ, Rubenstein JL, Yang Z. The Zinc Finger Transcription Factor Sp9 Is Required for the Development of Striatopallidal Projection Neurons. Cell Rep.2016
3 Seki T, Hosaka K, Lim S, Fischer C, Honek J, Yang Y, Andersson P, Nakamura M, Näslund E, Ylä-Herttuala S, Sun M, Iwamoto H, Li X, Liu Y, Samani NJ5, Cao Y. Endothelial PDGF-CC regulates angiogenesisdependent thermogenesis in beige fat. Nat Commun.2016
4 Li Z, Zheng M, Abdalla BA, Zhang Z, Xu Z, Ye Q, Xu H, Luo W, Nie Q, Zhang X. Genome-wide association study of aggressive behaviour in chicken. Sci Rep.2016
5 Lin W, Ma C, Su F, Jiang Y, Lai R, Zhang T, Sun K, Fan L, Cai Z, Li Z, Huang H, Li J, Wang X. Raf kinase inhibitor protein mediates intestinal epithelial cell apoptosis and promotes IBDs in humans and mice. Gut.2016
6 Liu Y, Gu Y, Han Y, Zhang Q, Jiang Z, Zhang X, Huang B, Xu X, Zheng J, Cao X. Tumor Exosomal RNAs Promote Lung Pre-metastatic Niche Formation by Activating Alveolar Epithelial TLR3 to Recruit Neutrophils. Cancer Cell.2016
7 Feng J, Yu SY, Li CZ, Li ZY, Zhang YZ. Integrative proteomics and transcriptomics revealed that activation of the IL-6R/JAK2/STAT3/MMP9 signaling pathway is correlated with invasion of pituitary null cell adenomas. Mol Cell Endocrinol.2016.
8 Zhang R, Zhu W, Mao S. High-concentrate feeding upregulates the expression of inflammation-related genes in the ruminal epithelium of dairy cattle. J Anim Sci Biotechnol.2016
9 Cheng G, He J, Zhang L, Ge S, Zhang H, Fan X3. HIC1 modulates uveal melanoma progression by activating lncRNA-numb. Tumour Biol.2016
10 Zhao Q, Kang Y, Wang HY, Guan WJ, Li XC, Jiang L, He XH, Pu YB, Han JL, Ma YH, Zhao QJ. Expression profiling and functional characterization of miR-192 throughout sheep skeletal muscle development. Sci Rep.2016
11 Zhou L, Liu Z, Liu Y, Kong D, Li T, Yu S, Mei H, Xu X, Liu H, Chen L, Luo L. A novel gene OsAHL1 improves both drought avoidance and drought tolerance in rice. Sci Rep.2016
12 Li J, Wang S, Anderson C, Zhao F, Qin Y, Wu D, Wu X, Liu J, He X, Zhao J, Zhang J. Requirement of Smad4 from Ocular Surface Ectoderm for Retinal Development. PLoS One.2016
